Mulai tahun pelajaran 2019/2020 PPDB menggunakan system zonasi dan online. Pendaftaran dan seleksi peserta didik baru SMPN 1 Wonosari dilaksanakan mulai dari hari Senin, 1 Juli 2019 sampai dengan Rabu, 3 Juli 2019. Untuk pendaftaran online di SMPN 1 Wonosari dilaksanakan di Lab. TIK utara. Pendaftaran online dihari pertama ini sangatlah ramai. Pukul 08.00 WIB mereka baru bisa log in dalam web PPDB. Pendaftaran online ini dipandu oleh panitia, yaitu dari bapak ibu guru serta perwakilan beberapa siswa dari pengurus OSIS dan MPK.

Setelah selesai melakukan pendaftaran online serta mencetak bukti pendaftaran dan kesanggupan orang tua, selanjutnya mereka mengumpulkan verifikasi dokumen pada loket-loket yang sudah dientukan. Dalam pendaftaran ini terdapat 5 loket. Siswa dinyatakanresmi mendaftar jika sudah melakukan verifikasi dokumen ke sekolah pilihan 1 (SMPN 1 Wonosari). Untuk pengumuman penerimaan siswa baru SMPN 1 Wonosari dilaksanakan pada hari Kamis, 4 Juli 2019. Sedangkan, untuk daftar ulang dilaksanakan pada hari Jumat, 5 Juli 2019.